Duas situações complementares estão presentes no dia-a-dia da sala de aula:

• momentos de trabalho individual, nos quais o aluno é desafiado a entrar em contato com o seu modo de aprender, para que possa definir seus novos desafios de acordo com suas necessidades e possibilidades;
  
• momentos de trabalho em grupo, onde a exigência é aprender a socializar não só os conhecimentos mas os modos de aprender.
  

A organização do currículo por áreas tem como foco a seleção de conteúdos significativos das ciências, dos códigos e linguagens que permitem a crescente compreensão e representação do mundo físico e social. Confira mais detalhes em Organização curricular.

Esse processo é assegurado pela presença de uma equipe multidisciplinar permanentemente envolvida na pesquisa do que, quando, como e para que ensinar. Essa estrutura permite a construção de metodologias e de material didático próprios.

A organização do Ensino Fundamental da Escola Vera Cruz é feita em três ciclos, constituídos por um conjunto de agrupamentos escolares que funcionam em espaços diferenciados: uma organização que possibilita a ambientação necessária às especificidades das faixas etárias.

• Ciclo I - composto pelo último agrupamento da Educação Infantil (G5) e pelos dois primeiros anos do Ensino Fundamental. 
  
• Ciclo II - constituído pelos 3°, 4° e 5° anos do Ensino Fundamental.
  
• Ciclo III - abrange 6°, 7°, 8° e 9° anos do Ensino Fundamental.